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在這個議題的爭議點的應用上主要是他們認為提供研究健保資料的去識別化是不是已經達到無從識別當事人的程度，這個議題大家有相當的爭議。人權團體主張健保署衛福部國衛院還是有可能被間接或直接識別，但他們認為資料已經去識別化依照法務部相關的意旨並非可直接知道。